Transferpass

Molekulare Biotechnologie und funktionelle Genomik

Angewandte Biowissenschaften

Strukturelle und funktionelle Genomik (Wetlab und Bioinformatik)
Analyse differenzieller Genexpression mit Systemen offener (subtraktive Techniken) und geschlossener Architektur (RT-PCR, Array-basierend) auf mRNA und Proteinebene
Funktionsanalyse einzelner Gene
Genotypisierung
Mutagenese und automatisiertes Screening von Mikroorganismen
Beratung bei Projekten im Übergang von der Genomik / Transkriptomik zur Anwendung
DNA / RNA und Proteinanalytik (s. u.: Genotypisierung, Multiplexanalytik, etc.)
Identifikation differenziell exprimierter Gene insbesondere in Nicht-Modell-Organismen / Systemen
Konstruktion von genomischen und cDNA Bibliotheken (auch subtrahierte und normalisierte)
High-Throughput-PCR und robotergestützte Analytik
Mikroskopie: RNA-InSitu und Immunhistochemie, Inkubation von Zellen / Organismen im Mikroskop für Zeitrafferaufnahmen, 3-D-Analyse, automatisierte Bilderkennung

Roche Lightcycler 480 RT-PCR System für Multititerplattenformate (96er und 384er)
Agilent 2100 Bioanalyzer Mikrofluidisches Lab-on-a-chip System für elektrophoretische und flow-cytometrische Anwendungen zur Analyse von DNA, RNA, Protein und Zellen
Nanodrop Spektrophotometer zur Analyse kleinster Probenmengen
Bioplex 200 (BioRad) Multiplex Suspension Array System zur simultanen Analyse von bis zu 100 Biomolekülen (DNA, Antikörper, etc.)
Spotter (Macro- und Microarrayer) für DNA und Proteine (Biogrid und Microgrid)
Pipettierroboter TECAN RSP 150 mit verschiedensten Funktionen (Kühlen, Wärmen, Mischen) und angeschlossenem Multititerplatten-Reader Genios
High-Throughput-PCR System Tetrade (MJ Research) für bis zu 1536 Reaktionen
Inverses gekapseltes Fluoreszenzmikroskop Keyence BZ-8100 mit digitaler Steuerung; 3D-Analyse in Echtzeit, Mehrkanal-Zeitrafferaufnahme; integrierter Inkubationskammer für Zellen u. ä.
Verschiedene Zeiss-Systeme für Fluoreszenzmikroskopie, mit entsprechender Kamera und Software
Hochleistungsrechner für Genomik und Bildverarbeitung
S1-Labor mit Cleanbench, Autoklav, Elektroporation, Gelelektrophorese (einschl. Puls-Feld) und digitaler Dokumentation, PCR, Crosslinker, umfangreichen Lagermöglichkeiten bei -80 Grad
Teile unseres Labors sind derzeit außerdem für den Umgang mit dem Pflanzenquarantäneschaderreger PSTVd zugelassen. Das Labor unterliegt einem QM Prozess und implementiert Standards nach ISO 9001 bzw. 17025

Patentanmeldungen aus Projekten mit einem Partner aus der Pharmaindustrie im Bereich Tumor- und Herz-Kreislaufforschung: WO03054541, WO0196561, WO0185936, WO0183745, WO0177148, WO0166762, WO0159133

Industrielle Partner: Oncoscience AG Wedel, Probiogen Berlin, Institut für angewandte Gewässerökologie Seddin, MedInnovation Wildau, Cyano Biofuels Berlin, Elsner PAC Dresden und andere
Akademische Partner: Deutsches Krebsforschungszentrum Heidelberg (verschiedene Abteilungen), Universitäten Irvine (Kalifornien), Galway (Irland), Poznan (Polen), Heidelberg, Würzburg, Aachen und Stuttgart, GSF Neuherberg, VTT Turku (Finnland) und andere
Langjährige Mitarbeit in der Abteilung Funktionelle Genomanalyse des deutschen Krebsforschungszentrums und fortgesetzte Kooperation