Transferpass
High Performance Computing in Life Sciences/Bioinformatik
Angewandte Biowissenschaften
Leistungsangebote
- Künstliche Intelligenz und Deep Learning in Life Sciences
- Machine Learning und Data Exploration
- Angewandte Bioinformatik in der Medizin und in den Biowissenschaften
- Bioprozessautomatisierung
- Sequenzanalyse
- Transkiptom- und Expressionsanalyse
- Systembiologie und Proteomanalyse
- Mathematische Modellierung
- Biostatistik
- Konzeption und Umsetzung von Automatisierungen (z.B. Flüssigkulturen mit Hilfe von Single-Board-Computern)
- Analysen zu differentieller Genexpression bzw. Expressionsmustern
- Auswertung von Sequenzier- und Microarray-Daten (cDNA, Oligos, SNPs, CGH)
- Netzwerkanalysen zu metabolischen, Transkriptions- und Signaltransduktionsnetzwerken
- Biostatistische Bewertung medizinisch-biologischer Daten
- Konzeption und Realisierung von individuell angepassten Datenbanken (z.B. Patientendaten, Primer- und Genomsequenzen...)
Labore
- High Performance Computing
- EDV-Komplexlabor (Bioinformatik)
Geräte / Spezialausstattung
- 1 Bladeserver System, 7 Knoten, 96 CPU Kerne, 2240 GB RAM, NVIDIA Tesla M2090
- 1 Bladeserver System, 6 Knoten, 80 CPU Kerne, 1920 GB RAM, zwei NVIDIA GRID K2, 28 TB integrierter Storage
- 50 TB zentraler Storage
- 48 Slot Tape Storage System
- 25 PCs mit je 4 CPU Kernen und 16 GB RAM und CUDA-fähigen Grafikkarten
Netzwerk-Mitgliedschaften
- Glyconet Berlin Brandenburg e. V.
Kooperationen
- Universität Hamburg
- UKE Hamburg
- Charité Berlin
- Endokrinologikum
- Novartis Pharma GmbH
- AnaTox GmbH & Co KG
